Zgjidhja e ushtrimit 2

Për të vizatuar strukturën e pjesshme të një vargu proteinik, ne paraqesim lidhjen peptidike midis dy aminoacideve fqinjë. Një lidhje peptidike formohet midis grupit karboksil ($-\text{COOH}$) të një aminoacidi dhe grupit amin ($-\text{NH}_2$) të aminoacidit tjetër, me eliminimin e një molekule uji. Kjo lidhje është një lidhje amide ($-\text{CO}-\text{NH}-$).

Struktura e pjesshme do të tregonte dy aminoacide të lidhura:

$$ \text{H}_2\text{N}-\text{CHR}_1-\text{CO}[\text{NH}-\text{CHR}_2-\text{CO}]\text{OH} $$

Ku $[\text{NH}-\text{CHR}_2-\text{CO}]$ paraqet lidhjen peptidike. Më saktësisht, në kuadrat do të futet vetëm pjesa e lidhjes:

Struktura e pjesshme me lidhjen peptidike në kuadrat:

$$ \text{H}_2\text{N}-\text{CHR}_1-\text{CO} \boxed{\text{NH}-\text{CHR}_2-\text{CO}} \text{NH}-\text{CHR}_3-\text{COOH} $$

Kjo paraqet tre aminoacide të lidhura, ku lidhja peptidike midis aminoacidit të parë dhe të dytë është në kuadrat.